Moin,
ohne jetzt miesepetrig wirken zu wollen, aber:
Du wirst leider nicht alles von dem, was in einer 3DS-Datei stecken kann, in eine OBJ-Datei überführen können. Auch wirst Du nicht alles, von dem was in der ursprünglichen 3DS Datei stand, mit Java3D darstellen können. Und je "kompliziertere Dinge" dargestellt werden sollen, je komplizierter wird auch alles andere.
Viele Grüße,
Fancy