direkt starten kannst du imho nicht. Unter Windows benötigst du eine Autostart.ini, die das auszuführende Programm beschreibt. Imho funtioniert das nicht mit jars oder .classes. D. h. du musst dir eine batch-Datei schreiben, die du aufrufst, und die dann wiederrum dein Prog aufrufst. Eine exe kannst du über Runtime.getRuntime().exec() ausführen. Oder hab Java 6 über die Klasse Desktop.