du musst mit dem neuen doc-Objekt arbeiten
--> das war der entscheidende Hinweis 
Vielen Dank für deine Hilfe
so läuft es jetzt
[code=Java]if (file.exists()){
DocumentBuilderFactory docFactory = DocumentBuilderFactory.newInstance();
DocumentBuilder docBuilder;
docBuilder = docFactory.newDocumentBuilder();
Document doc;
doc = docBuilder.parse(file);
doc.getDocumentElement().normalize();
Element rootElement = doc.getDocumentElement();
Element ConfigurationItem = doc.createElement ("ConfigurationItem");
rootElement.appendChild(ConfigurationItem);
...[/code]