trag mal -consoleLog in der run-configuration deines programms ein (im reiter arguments)
edit: ach so, binde mal die plugins mit ein, die für die console notwendig sind, dann sollte es spätestens gehen (afaik werden dann alle sachen dort hingeschrieben).
alternativ kannst du auch die System.outs austauschen gegen
<dein-plugin>.getDefault().getLog().log(new Status(IStatus.ERROR, <deine-plugin-id>, IStatus.OK, <deine-nachricht>, <deine-exception>));
das gilt dafür, das du ein singleton-plugin nutzt, "new Status()" kann auch kürzer ausfallen (sieh API-doc).
das ganze landet dann in der .log-Datei deines default "workspaces" (siehe run-config deiner app, reiter mai, dort unter location)
viele grüße,
daniel
