tipp steht da ja. eine datei auslesen kannst du ja bestimmt bereits,ansonsten mal schnell googlen (ist nicht schwer). zu JDBC gibt es ebenfalls zich tutorials, aber da du ja etwas ausführen willst, vermute ich,dass du bereits Erfahrung mit Datenbankprogrammierung hast.
Bleibt nur noch eine Datei schreiben basierend auf dem ResultSet: siehe "java textdatei erstellen"