Du kannst mit JAVA keine Dinge außerhalb von deiner VM angreifen,abfragen, irgendwas ändern, etc
Du könntes das via JNI und nem C Programm lösen (Programm müßte halt alle aktiven Fenster absuchen und das auf welches das dann zutrifft wiederherstellen) oder vielleicht hat Windows ja einen rundll Befehl mit dem man die Fenster maximieren kann!