BufferedReader (JFileChooser)

[sim26]

Wie kann man mit JFileChooser eine Datei rufen aber durch BufferedReader (Biojava)!
(Ich will damit die „länge“ von meinem Sequence rechnen)

Habe folgendes gemacht für ein normale Datei zu importieren und hat geklappt

JFileChooser chooser = new JFileChooser(".txt");
int result = chooser.showOpenDialog(null);
if(result = = JFileChooser.APPROVE_OPTION){
   File file=chooser.getSelectedFile();

   try{

      lengh2.setText( ""+file.length()); //lengh2= JTextField
   }catch(Exception r) {
      r.printStackTrace();
   }
}

Aber dann für ein DNA sequence habe folgendes geändert aber keine Chance, klappt nicht!!!!!!!

String Sequence;

BufferedReader br = null;
SequenceIterator sequences = SeqIOTools.readEmbl(br);

JFileChooser chooser = new JFileChooser(".txt");
int result = chooser.showOpenDialog(null);
if(result = = JFileChooser.APPROVE_OPTION){
   File file=chooser.getSelectedFile();

   while(sequences.hasNext()){
      try{
         BufferedReader br=new BufferedReader(new FileReader(file));
         Sequence file = sequences.nextSequence();

         lengh2.setText( ""+file.length()); //lengh2= JTextField
      }catch(Exception r) {
         r.printStackTrace();
      }
   }
}

Kann jemand bitte mir helfen?

[Edit by Beni: Codetags & Einrückung]

 

[norman]

Hallo sim26,
du hast einmal einen File namens "file" und einmal eine Sequence namens "file"..das ist nicht besonders tricky :wink:
jedenfalls gibt dir file.length() die länge des File-Objektes, nicht des Sequence-Objektes (Sequence hat keine length()-Methode).

 

[sim26]

Hallo Norman,

danke für deine antwort, das Problem habe ich schon gestern gelöst ;-) (schönes gefühl)

Ich habe einmal einen File namens "file" und einmal eine Sequence namens "file". Das war nicht schlau von mir auch noch habe return vergessen und in meinen Programmen selbst waren paar Funktionen nicht richtig initialisiert.

Danke noch mal

Sim26