Dann lies mal ein Anfängerbuch deiner Wahl oder benutze die Forensuche
.
Stichwörter für dein 1. Problem:
Runtime#getRuntime#exec und Process
Stichwörter für dein 2. Problem:
BufferedReader und BufferedWriter für Textdateien, für Binäre Dateien BufferedInputStream und BufferedOutputStream
[edit] verdammt, schon wieder zu langsam 